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La précédente découverte du redoutable virus H5N1 remontait à mars 2007, sur des cadavres d'oiseaux retrouvés sur l'île de Kyushu (sud).
Les analyses ont confirmé la présence du même virus sur trois cygnes morts et un autre agonisant retrouvés dans le lac Towada, dans la préfecture d'Akita (nord), à quelque 550 km au nord de Tokyo, a annoncé le gouvernement local dans un communiqué.
Une inspection va être menée mercredi et jeudi dans 15 élevages de volailles situées dans un rayon de 30 km autour du lac, a précisé le communiqué. Environ 42.000 poulets sont concernés par ces vérifications.
"Nous allons voir s'il est nécessaire de prendre des mesures, telles que des filets anti-oiseaux, afin d'empêcher des oiseaux sauvages de pénétrer dans les fermes d'élevage", a déclaré un responsable sanitaire de la préfecture d'Akita, Takayo Yamaguchi.
Quatre foyers de H5N1 avaient été rapportés dans des élevages japonais en janvier et février 2007, poussant les autorités à demander par mesure de précaution l'abattage de dizaines de milliers de poulets.
Le virus H5N1 a tué plus de 230 personnes dans le monde depuis son apparition fin 2003, par le biais de contacts avec des volatiles infectés, dont la moitié des cas en Indonésie.
Les experts de l'Organisation mondiale de la santé (OMS) craignent qu'une mutation du virus, lui permettant de se transmettre d'homme à homme, provoque une pandémie faisant des millions de morts à travers le monde.
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